Protein–RNA interactions for Protein: Q08881

ITK, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITKQ08881 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITKQ08881 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITKQ08881 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITKQ08881 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITKQ08881 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITKQ08881 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITKQ08881 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITKQ08881 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITKQ08881 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITKQ08881 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITKQ08881 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITKQ08881 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITKQ08881 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITKQ08881 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITKQ08881 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITKQ08881 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITKQ08881 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITKQ08881 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITKQ08881 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITKQ08881 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITKQ08881 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITKQ08881 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITKQ08881 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITKQ08881 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITKQ08881 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITKQ08881 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITKQ08881 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITKQ08881 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITKQ08881 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITKQ08881 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITKQ08881 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITKQ08881 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITKQ08881 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITKQ08881 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITKQ08881 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITKQ08881 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITKQ08881 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITKQ08881 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITKQ08881 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITKQ08881 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITKQ08881 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITKQ08881 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITKQ08881 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITKQ08881 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ITKQ08881 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITKQ08881 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITKQ08881 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITKQ08881 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITKQ08881 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITKQ08881 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITKQ08881 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITKQ08881 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITKQ08881 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITKQ08881 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITKQ08881 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITKQ08881 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITKQ08881 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITKQ08881 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITKQ08881 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITKQ08881 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITKQ08881 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITKQ08881 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITKQ08881 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITKQ08881 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITKQ08881 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITKQ08881 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITKQ08881 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITKQ08881 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ITKQ08881 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITKQ08881 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITKQ08881 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITKQ08881 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITKQ08881 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITKQ08881 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITKQ08881 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITKQ08881 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITKQ08881 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITKQ08881 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITKQ08881 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITKQ08881 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITKQ08881 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITKQ08881 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITKQ08881 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITKQ08881 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITKQ08881 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITKQ08881 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITKQ08881 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITKQ08881 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITKQ08881 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITKQ08881 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITKQ08881 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITKQ08881 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITKQ08881 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITKQ08881 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITKQ08881 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITKQ08881 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITKQ08881 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITKQ08881 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITKQ08881 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITKQ08881 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms