Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC47.84■■■■■ 5.25
TOP2BQ02880 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
TOP2BQ02880 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC47.82■■■■■ 5.25
TOP2BQ02880 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC47.79■■■■■ 5.24
TOP2BQ02880 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
TOP2BQ02880 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
TOP2BQ02880 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC47.73■■■■■ 5.23
TOP2BQ02880 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.7■■■■■ 5.23
TOP2BQ02880 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC47.69■■■■■ 5.23
TOP2BQ02880 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC47.66■■■■■ 5.22
TOP2BQ02880 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
TOP2BQ02880 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC47.65■■■■■ 5.22
TOP2BQ02880 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.21
TOP2BQ02880 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
TOP2BQ02880 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
TOP2BQ02880 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
TOP2BQ02880 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
TOP2BQ02880 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
TOP2BQ02880 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC47.49■■■■■ 5.19
TOP2BQ02880 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC47.48■■■■■ 5.19
TOP2BQ02880 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
TOP2BQ02880 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
TOP2BQ02880 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.19
TOP2BQ02880 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
TOP2BQ02880 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
TOP2BQ02880 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC47.41■■■■■ 5.18
TOP2BQ02880 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC47.41■■■■■ 5.18
TOP2BQ02880 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
TOP2BQ02880 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
TOP2BQ02880 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
TOP2BQ02880 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
TOP2BQ02880 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
TOP2BQ02880 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
TOP2BQ02880 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
TOP2BQ02880 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC47.29■■■■■ 5.16
TOP2BQ02880 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC47.28■■■■■ 5.16
TOP2BQ02880 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC47.26■■■■■ 5.16
TOP2BQ02880 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
TOP2BQ02880 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC47.26■■■■■ 5.16
TOP2BQ02880 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
TOP2BQ02880 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
TOP2BQ02880 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
TOP2BQ02880 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.23■■■■■ 5.15
TOP2BQ02880 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC47.22■■■■■ 5.15
TOP2BQ02880 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
TOP2BQ02880 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
TOP2BQ02880 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
TOP2BQ02880 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.14
TOP2BQ02880 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
TOP2BQ02880 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
TOP2BQ02880 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
TOP2BQ02880 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.14■■■■■ 5.14
TOP2BQ02880 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC47.14■■■■■ 5.14
TOP2BQ02880 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC47.14■■■■■ 5.14
TOP2BQ02880 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC47.11■■■■■ 5.13
TOP2BQ02880 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
TOP2BQ02880 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC47.08■■■■■ 5.13
TOP2BQ02880 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC47.08■■■■■ 5.13
TOP2BQ02880 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
TOP2BQ02880 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
TOP2BQ02880 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC46.98■■■■■ 5.11
TOP2BQ02880 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
TOP2BQ02880 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
TOP2BQ02880 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
TOP2BQ02880 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
TOP2BQ02880 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
TOP2BQ02880 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC46.94■■■■■ 5.1
TOP2BQ02880 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
TOP2BQ02880 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
TOP2BQ02880 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
TOP2BQ02880 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
TOP2BQ02880 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
TOP2BQ02880 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.88■■■■■ 5.1
TOP2BQ02880 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
TOP2BQ02880 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.86■■■■■ 5.09
TOP2BQ02880 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC46.86■■■■■ 5.09
TOP2BQ02880 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
TOP2BQ02880 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
TOP2BQ02880 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
TOP2BQ02880 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC46.8■■■■■ 5.08
TOP2BQ02880 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
TOP2BQ02880 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
TOP2BQ02880 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC46.79■■■■■ 5.08
TOP2BQ02880 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
TOP2BQ02880 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
TOP2BQ02880 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
TOP2BQ02880 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
TOP2BQ02880 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC46.69■■■■■ 5.07
TOP2BQ02880 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
TOP2BQ02880 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
TOP2BQ02880 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.66■■■■■ 5.06
TOP2BQ02880 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.66■■■■■ 5.06
TOP2BQ02880 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC46.64■■■■■ 5.06
TOP2BQ02880 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
TOP2BQ02880 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC46.62■■■■■ 5.05
TOP2BQ02880 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
TOP2BQ02880 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
TOP2BQ02880 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC46.58■■■■■ 5.05
TOP2BQ02880 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.57■■■■■ 5.05
TOP2BQ02880 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.57■■■■■ 5.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms