Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CAP1Q01518 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAP1Q01518 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAP1Q01518 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CAP1Q01518 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAP1Q01518 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAP1Q01518 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CAP1Q01518 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CAP1Q01518 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CAP1Q01518 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CAP1Q01518 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CAP1Q01518 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CAP1Q01518 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CAP1Q01518 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CAP1Q01518 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CAP1Q01518 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CAP1Q01518 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CAP1Q01518 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CAP1Q01518 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CAP1Q01518 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CAP1Q01518 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CAP1Q01518 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CAP1Q01518 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CAP1Q01518 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CAP1Q01518 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CAP1Q01518 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CAP1Q01518 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CAP1Q01518 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CAP1Q01518 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CAP1Q01518 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CAP1Q01518 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CAP1Q01518 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CAP1Q01518 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CAP1Q01518 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CAP1Q01518 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CAP1Q01518 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CAP1Q01518 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CAP1Q01518 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CAP1Q01518 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CAP1Q01518 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CAP1Q01518 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CAP1Q01518 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CAP1Q01518 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CAP1Q01518 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CAP1Q01518 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CAP1Q01518 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CAP1Q01518 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CAP1Q01518 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CAP1Q01518 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CAP1Q01518 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CAP1Q01518 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CAP1Q01518 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CAP1Q01518 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CAP1Q01518 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CAP1Q01518 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CAP1Q01518 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CAP1Q01518 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CAP1Q01518 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CAP1Q01518 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CAP1Q01518 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CAP1Q01518 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CAP1Q01518 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CAP1Q01518 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CAP1Q01518 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CAP1Q01518 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CAP1Q01518 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CAP1Q01518 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CAP1Q01518 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAP1Q01518 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAP1Q01518 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAP1Q01518 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAP1Q01518 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CAP1Q01518 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CAP1Q01518 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CAP1Q01518 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CAP1Q01518 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CAP1Q01518 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CAP1Q01518 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CAP1Q01518 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CAP1Q01518 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CAP1Q01518 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAP1Q01518 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAP1Q01518 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAP1Q01518 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CAP1Q01518 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CAP1Q01518 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CAP1Q01518 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CAP1Q01518 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CAP1Q01518 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CAP1Q01518 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CAP1Q01518 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CAP1Q01518 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CAP1Q01518 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CAP1Q01518 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CAP1Q01518 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CAP1Q01518 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CAP1Q01518 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
CAP1Q01518 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CAP1Q01518 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CAP1Q01518 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms