Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX6-1P78426 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX6-1P78426 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX6-1P78426 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX6-1P78426 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX6-1P78426 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX6-1P78426 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX6-1P78426 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX6-1P78426 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX6-1P78426 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX6-1P78426 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX6-1P78426 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX6-1P78426 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX6-1P78426 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX6-1P78426 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX6-1P78426 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX6-1P78426 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX6-1P78426 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX6-1P78426 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX6-1P78426 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX6-1P78426 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX6-1P78426 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX6-1P78426 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX6-1P78426 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX6-1P78426 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX6-1P78426 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX6-1P78426 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX6-1P78426 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX6-1P78426 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX6-1P78426 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX6-1P78426 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX6-1P78426 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX6-1P78426 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX6-1P78426 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX6-1P78426 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX6-1P78426 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX6-1P78426 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX6-1P78426 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX6-1P78426 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX6-1P78426 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX6-1P78426 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX6-1P78426 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX6-1P78426 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX6-1P78426 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX6-1P78426 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX6-1P78426 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX6-1P78426 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX6-1P78426 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX6-1P78426 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX6-1P78426 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX6-1P78426 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX6-1P78426 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX6-1P78426 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX6-1P78426 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX6-1P78426 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX6-1P78426 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX6-1P78426 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX6-1P78426 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX6-1P78426 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX6-1P78426 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX6-1P78426 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX6-1P78426 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX6-1P78426 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX6-1P78426 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX6-1P78426 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX6-1P78426 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX6-1P78426 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms