Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLDN10P78369 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLDN10P78369 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLDN10P78369 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLDN10P78369 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLDN10P78369 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLDN10P78369 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLDN10P78369 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLDN10P78369 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLDN10P78369 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLDN10P78369 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLDN10P78369 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLDN10P78369 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLDN10P78369 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLDN10P78369 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLDN10P78369 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLDN10P78369 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLDN10P78369 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLDN10P78369 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLDN10P78369 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLDN10P78369 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLDN10P78369 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLDN10P78369 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLDN10P78369 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLDN10P78369 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLDN10P78369 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLDN10P78369 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLDN10P78369 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLDN10P78369 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLDN10P78369 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLDN10P78369 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLDN10P78369 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLDN10P78369 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLDN10P78369 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLDN10P78369 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLDN10P78369 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLDN10P78369 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLDN10P78369 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLDN10P78369 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CLDN10P78369 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLDN10P78369 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLDN10P78369 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLDN10P78369 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLDN10P78369 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLDN10P78369 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CLDN10P78369 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLDN10P78369 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLDN10P78369 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLDN10P78369 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLDN10P78369 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLDN10P78369 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CLDN10P78369 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLDN10P78369 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLDN10P78369 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLDN10P78369 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLDN10P78369 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLDN10P78369 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLDN10P78369 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLDN10P78369 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLDN10P78369 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLDN10P78369 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms