Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GTF2IP78347 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
GTF2IP78347 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GTF2IP78347 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GTF2IP78347 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GTF2IP78347 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GTF2IP78347 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GTF2IP78347 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GTF2IP78347 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GTF2IP78347 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GTF2IP78347 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GTF2IP78347 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GTF2IP78347 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GTF2IP78347 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GTF2IP78347 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GTF2IP78347 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
GTF2IP78347 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GTF2IP78347 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34■■■■□ 3.03
GTF2IP78347 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GTF2IP78347 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GTF2IP78347 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GTF2IP78347 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GTF2IP78347 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GTF2IP78347 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GTF2IP78347 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GTF2IP78347 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GTF2IP78347 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GTF2IP78347 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GTF2IP78347 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GTF2IP78347 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GTF2IP78347 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GTF2IP78347 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GTF2IP78347 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GTF2IP78347 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GTF2IP78347 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GTF2IP78347 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GTF2IP78347 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GTF2IP78347 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
GTF2IP78347 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GTF2IP78347 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GTF2IP78347 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GTF2IP78347 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
GTF2IP78347 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GTF2IP78347 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
GTF2IP78347 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
GTF2IP78347 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GTF2IP78347 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
GTF2IP78347 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GTF2IP78347 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GTF2IP78347 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GTF2IP78347 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GTF2IP78347 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GTF2IP78347 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GTF2IP78347 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GTF2IP78347 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GTF2IP78347 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GTF2IP78347 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GTF2IP78347 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GTF2IP78347 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GTF2IP78347 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
GTF2IP78347 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GTF2IP78347 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GTF2IP78347 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GTF2IP78347 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GTF2IP78347 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GTF2IP78347 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GTF2IP78347 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
GTF2IP78347 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
GTF2IP78347 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
GTF2IP78347 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GTF2IP78347 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
GTF2IP78347 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GTF2IP78347 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GTF2IP78347 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GTF2IP78347 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GTF2IP78347 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GTF2IP78347 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GTF2IP78347 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
GTF2IP78347 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GTF2IP78347 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GTF2IP78347 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GTF2IP78347 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GTF2IP78347 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GTF2IP78347 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
GTF2IP78347 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GTF2IP78347 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GTF2IP78347 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GTF2IP78347 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GTF2IP78347 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GTF2IP78347 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GTF2IP78347 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
GTF2IP78347 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GTF2IP78347 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GTF2IP78347 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GTF2IP78347 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
GTF2IP78347 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GTF2IP78347 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GTF2IP78347 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
GTF2IP78347 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GTF2IP78347 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms