Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.15■■■■■ 4.34
GTF2IP78347 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
GTF2IP78347 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
GTF2IP78347 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
GTF2IP78347 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
GTF2IP78347 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
GTF2IP78347 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
GTF2IP78347 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
GTF2IP78347 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
GTF2IP78347 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
GTF2IP78347 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GTF2IP78347 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
GTF2IP78347 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
GTF2IP78347 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GTF2IP78347 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
GTF2IP78347 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
GTF2IP78347 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GTF2IP78347 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
GTF2IP78347 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
GTF2IP78347 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
GTF2IP78347 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
GTF2IP78347 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GTF2IP78347 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
GTF2IP78347 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
GTF2IP78347 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
GTF2IP78347 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
GTF2IP78347 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
GTF2IP78347 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
GTF2IP78347 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
GTF2IP78347 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
GTF2IP78347 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GTF2IP78347 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
GTF2IP78347 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
GTF2IP78347 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GTF2IP78347 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
GTF2IP78347 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
GTF2IP78347 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
GTF2IP78347 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GTF2IP78347 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GTF2IP78347 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GTF2IP78347 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GTF2IP78347 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GTF2IP78347 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GTF2IP78347 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GTF2IP78347 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GTF2IP78347 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GTF2IP78347 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GTF2IP78347 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GTF2IP78347 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GTF2IP78347 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GTF2IP78347 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GTF2IP78347 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
GTF2IP78347 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
GTF2IP78347 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GTF2IP78347 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GTF2IP78347 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GTF2IP78347 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GTF2IP78347 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GTF2IP78347 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GTF2IP78347 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GTF2IP78347 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GTF2IP78347 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GTF2IP78347 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GTF2IP78347 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GTF2IP78347 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GTF2IP78347 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GTF2IP78347 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GTF2IP78347 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GTF2IP78347 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GTF2IP78347 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GTF2IP78347 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GTF2IP78347 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GTF2IP78347 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GTF2IP78347 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
GTF2IP78347 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GTF2IP78347 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GTF2IP78347 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GTF2IP78347 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GTF2IP78347 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
GTF2IP78347 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GTF2IP78347 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GTF2IP78347 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GTF2IP78347 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GTF2IP78347 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GTF2IP78347 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GTF2IP78347 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
GTF2IP78347 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GTF2IP78347 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
GTF2IP78347 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GTF2IP78347 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GTF2IP78347 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GTF2IP78347 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GTF2IP78347 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GTF2IP78347 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
GTF2IP78347 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
GTF2IP78347 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
GTF2IP78347 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GTF2IP78347 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GTF2IP78347 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
GTF2IP78347 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms