Protein–RNA interactions for Protein: P63220

RPS21, 40S ribosomal protein S21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS21P63220 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS21P63220 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS21P63220 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS21P63220 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS21P63220 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS21P63220 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS21P63220 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS21P63220 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS21P63220 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS21P63220 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS21P63220 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS21P63220 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS21P63220 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS21P63220 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS21P63220 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS21P63220 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS21P63220 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS21P63220 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS21P63220 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS21P63220 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS21P63220 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS21P63220 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS21P63220 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPS21P63220 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS21P63220 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS21P63220 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS21P63220 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS21P63220 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS21P63220 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPS21P63220 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS21P63220 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS21P63220 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS21P63220 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS21P63220 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS21P63220 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS21P63220 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS21P63220 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS21P63220 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS21P63220 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS21P63220 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS21P63220 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS21P63220 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPS21P63220 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS21P63220 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS21P63220 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS21P63220 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS21P63220 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS21P63220 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RPS21P63220 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS21P63220 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS21P63220 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS21P63220 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS21P63220 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPS21P63220 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPS21P63220 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS21P63220 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS21P63220 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS21P63220 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS21P63220 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS21P63220 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS21P63220 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS21P63220 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS21P63220 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS21P63220 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS21P63220 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS21P63220 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS21P63220 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS21P63220 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS21P63220 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS21P63220 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS21P63220 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS21P63220 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPS21P63220 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS21P63220 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS21P63220 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS21P63220 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS21P63220 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS21P63220 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS21P63220 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS21P63220 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS21P63220 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS21P63220 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS21P63220 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS21P63220 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS21P63220 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS21P63220 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS21P63220 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS21P63220 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS21P63220 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS21P63220 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS21P63220 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS21P63220 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS21P63220 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS21P63220 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS21P63220 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS21P63220 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS21P63220 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS21P63220 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS21P63220 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS21P63220 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms