Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP46P62068 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP46P62068 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP46P62068 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP46P62068 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP46P62068 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP46P62068 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP46P62068 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP46P62068 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP46P62068 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP46P62068 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP46P62068 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP46P62068 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP46P62068 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP46P62068 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP46P62068 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP46P62068 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP46P62068 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP46P62068 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP46P62068 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP46P62068 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP46P62068 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP46P62068 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
USP46P62068 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP46P62068 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP46P62068 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
USP46P62068 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP46P62068 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP46P62068 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP46P62068 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP46P62068 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP46P62068 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP46P62068 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
USP46P62068 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP46P62068 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP46P62068 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP46P62068 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP46P62068 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP46P62068 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP46P62068 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP46P62068 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP46P62068 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP46P62068 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP46P62068 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP46P62068 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP46P62068 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP46P62068 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP46P62068 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP46P62068 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP46P62068 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP46P62068 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP46P62068 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP46P62068 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP46P62068 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP46P62068 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP46P62068 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP46P62068 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP46P62068 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP46P62068 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP46P62068 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP46P62068 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP46P62068 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP46P62068 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP46P62068 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP46P62068 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP46P62068 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP46P62068 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP46P62068 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP46P62068 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP46P62068 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP46P62068 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP46P62068 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP46P62068 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP46P62068 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP46P62068 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP46P62068 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP46P62068 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP46P62068 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
USP46P62068 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP46P62068 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP46P62068 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP46P62068 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP46P62068 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP46P62068 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP46P62068 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP46P62068 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP46P62068 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP46P62068 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP46P62068 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP46P62068 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP46P62068 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP46P62068 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP46P62068 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP46P62068 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP46P62068 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP46P62068 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP46P62068 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP46P62068 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP46P62068 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP46P62068 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms