Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRTAP10-9P60411 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRTAP10-9P60411 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRTAP10-9P60411 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRTAP10-9P60411 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRTAP10-9P60411 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRTAP10-9P60411 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRTAP10-9P60411 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRTAP10-9P60411 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRTAP10-9P60411 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRTAP10-9P60411 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRTAP10-9P60411 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRTAP10-9P60411 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRTAP10-9P60411 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRTAP10-9P60411 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRTAP10-9P60411 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRTAP10-9P60411 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRTAP10-9P60411 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRTAP10-9P60411 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRTAP10-9P60411 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRTAP10-9P60411 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRTAP10-9P60411 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRTAP10-9P60411 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRTAP10-9P60411 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRTAP10-9P60411 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRTAP10-9P60411 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRTAP10-9P60411 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRTAP10-9P60411 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRTAP10-9P60411 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRTAP10-9P60411 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRTAP10-9P60411 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRTAP10-9P60411 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRTAP10-9P60411 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRTAP10-9P60411 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRTAP10-9P60411 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRTAP10-9P60411 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRTAP10-9P60411 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRTAP10-9P60411 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRTAP10-9P60411 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRTAP10-9P60411 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRTAP10-9P60411 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRTAP10-9P60411 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRTAP10-9P60411 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRTAP10-9P60411 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRTAP10-9P60411 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRTAP10-9P60411 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRTAP10-9P60411 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRTAP10-9P60411 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRTAP10-9P60411 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRTAP10-9P60411 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRTAP10-9P60411 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRTAP10-9P60411 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRTAP10-9P60411 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRTAP10-9P60411 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTAP10-9P60411 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTAP10-9P60411 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTAP10-9P60411 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTAP10-9P60411 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTAP10-9P60411 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTAP10-9P60411 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRTAP10-9P60411 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KRTAP10-9P60411 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRTAP10-9P60411 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRTAP10-9P60411 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRTAP10-9P60411 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRTAP10-9P60411 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRTAP10-9P60411 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRTAP10-9P60411 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRTAP10-9P60411 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRTAP10-9P60411 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRTAP10-9P60411 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRTAP10-9P60411 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRTAP10-9P60411 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRTAP10-9P60411 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRTAP10-9P60411 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRTAP10-9P60411 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRTAP10-9P60411 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRTAP10-9P60411 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRTAP10-9P60411 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRTAP10-9P60411 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRTAP10-9P60411 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRTAP10-9P60411 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRTAP10-9P60411 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRTAP10-9P60411 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRTAP10-9P60411 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRTAP10-9P60411 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRTAP10-9P60411 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRTAP10-9P60411 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRTAP10-9P60411 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRTAP10-9P60411 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRTAP10-9P60411 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRTAP10-9P60411 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRTAP10-9P60411 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KRTAP10-9P60411 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRTAP10-9P60411 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRTAP10-9P60411 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRTAP10-9P60411 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRTAP10-9P60411 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRTAP10-9P60411 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRTAP10-9P60411 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms