Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMP1P54849 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMP1P54849 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMP1P54849 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMP1P54849 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMP1P54849 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMP1P54849 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMP1P54849 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMP1P54849 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMP1P54849 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMP1P54849 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EMP1P54849 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMP1P54849 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMP1P54849 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMP1P54849 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMP1P54849 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMP1P54849 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMP1P54849 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMP1P54849 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMP1P54849 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMP1P54849 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMP1P54849 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMP1P54849 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMP1P54849 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMP1P54849 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMP1P54849 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMP1P54849 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMP1P54849 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMP1P54849 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMP1P54849 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMP1P54849 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMP1P54849 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMP1P54849 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EMP1P54849 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMP1P54849 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMP1P54849 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMP1P54849 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMP1P54849 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP1P54849 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP1P54849 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP1P54849 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMP1P54849 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP1P54849 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP1P54849 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP1P54849 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMP1P54849 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP1P54849 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMP1P54849 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP1P54849 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP1P54849 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMP1P54849 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP1P54849 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMP1P54849 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMP1P54849 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMP1P54849 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMP1P54849 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMP1P54849 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMP1P54849 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMP1P54849 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMP1P54849 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMP1P54849 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMP1P54849 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EMP1P54849 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EMP1P54849 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EMP1P54849 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EMP1P54849 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EMP1P54849 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EMP1P54849 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EMP1P54849 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EMP1P54849 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EMP1P54849 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EMP1P54849 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EMP1P54849 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EMP1P54849 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EMP1P54849 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EMP1P54849 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EMP1P54849 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EMP1P54849 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EMP1P54849 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EMP1P54849 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EMP1P54849 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EMP1P54849 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EMP1P54849 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EMP1P54849 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EMP1P54849 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EMP1P54849 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EMP1P54849 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EMP1P54849 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EMP1P54849 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EMP1P54849 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EMP1P54849 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EMP1P54849 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EMP1P54849 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EMP1P54849 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EMP1P54849 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EMP1P54849 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EMP1P54849 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EMP1P54849 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EMP1P54849 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EMP1P54849 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms