Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPHB1P54762 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPHB1P54762 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPHB1P54762 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPHB1P54762 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPHB1P54762 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPHB1P54762 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPHB1P54762 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPHB1P54762 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPHB1P54762 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPHB1P54762 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPHB1P54762 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPHB1P54762 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPHB1P54762 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPHB1P54762 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPHB1P54762 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPHB1P54762 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPHB1P54762 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB1P54762 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPHB1P54762 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPHB1P54762 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPHB1P54762 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPHB1P54762 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPHB1P54762 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPHB1P54762 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPHB1P54762 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPHB1P54762 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPHB1P54762 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPHB1P54762 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPHB1P54762 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPHB1P54762 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHB1P54762 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHB1P54762 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPHB1P54762 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPHB1P54762 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPHB1P54762 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHB1P54762 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHB1P54762 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHB1P54762 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHB1P54762 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHB1P54762 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHB1P54762 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPHB1P54762 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPHB1P54762 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPHB1P54762 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPHB1P54762 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB1P54762 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB1P54762 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EPHB1P54762 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHB1P54762 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPHB1P54762 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB1P54762 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB1P54762 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB1P54762 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB1P54762 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB1P54762 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB1P54762 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB1P54762 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB1P54762 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPHB1P54762 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB1P54762 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPHB1P54762 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPHB1P54762 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPHB1P54762 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPHB1P54762 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPHB1P54762 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB1P54762 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPHB1P54762 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPHB1P54762 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB1P54762 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB1P54762 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB1P54762 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHB1P54762 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHB1P54762 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHB1P54762 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB1P54762 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB1P54762 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB1P54762 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB1P54762 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB1P54762 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB1P54762 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB1P54762 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EPHB1P54762 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB1P54762 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB1P54762 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms