Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EPHB1P54762 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
EPHB1P54762 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
EPHB1P54762 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
EPHB1P54762 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EPHB1P54762 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EPHB1P54762 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
EPHB1P54762 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
EPHB1P54762 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EPHB1P54762 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EPHB1P54762 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
EPHB1P54762 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
EPHB1P54762 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EPHB1P54762 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
EPHB1P54762 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EPHB1P54762 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EPHB1P54762 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
EPHB1P54762 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
EPHB1P54762 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
EPHB1P54762 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EPHB1P54762 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
EPHB1P54762 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EPHB1P54762 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EPHB1P54762 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
EPHB1P54762 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
EPHB1P54762 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EPHB1P54762 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EPHB1P54762 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EPHB1P54762 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EPHB1P54762 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
EPHB1P54762 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
EPHB1P54762 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
EPHB1P54762 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
EPHB1P54762 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EPHB1P54762 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EPHB1P54762 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EPHB1P54762 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EPHB1P54762 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EPHB1P54762 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EPHB1P54762 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EPHB1P54762 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EPHB1P54762 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EPHB1P54762 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EPHB1P54762 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
EPHB1P54762 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
EPHB1P54762 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EPHB1P54762 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EPHB1P54762 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EPHB1P54762 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EPHB1P54762 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EPHB1P54762 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EPHB1P54762 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EPHB1P54762 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EPHB1P54762 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EPHB1P54762 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EPHB1P54762 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EPHB1P54762 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EPHB1P54762 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
EPHB1P54762 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EPHB1P54762 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EPHB1P54762 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EPHB1P54762 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EPHB1P54762 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EPHB1P54762 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EPHB1P54762 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EPHB1P54762 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EPHB1P54762 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EPHB1P54762 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EPHB1P54762 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EPHB1P54762 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EPHB1P54762 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EPHB1P54762 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
EPHB1P54762 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EPHB1P54762 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EPHB1P54762 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EPHB1P54762 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
EPHB1P54762 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EPHB1P54762 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EPHB1P54762 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EPHB1P54762 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EPHB1P54762 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EPHB1P54762 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
EPHB1P54762 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EPHB1P54762 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EPHB1P54762 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EPHB1P54762 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EPHB1P54762 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EPHB1P54762 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EPHB1P54762 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EPHB1P54762 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EPHB1P54762 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHB1P54762 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EPHB1P54762 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPHB1P54762 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPHB1P54762 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPHB1P54762 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPHB1P54762 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EPHB1P54762 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPHB1P54762 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
EPHB1P54762 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms