Protein–RNA interactions for Protein: P53816

PLA2G16, HRAS-like suppressor 3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G16P53816 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLA2G16P53816 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLA2G16P53816 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLA2G16P53816 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLA2G16P53816 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLA2G16P53816 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLA2G16P53816 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PLA2G16P53816 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLA2G16P53816 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLA2G16P53816 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLA2G16P53816 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLA2G16P53816 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms