Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLCNKBP51801 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLCNKBP51801 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLCNKBP51801 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLCNKBP51801 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLCNKBP51801 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CLCNKBP51801 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLCNKBP51801 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLCNKBP51801 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLCNKBP51801 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CLCNKBP51801 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLCNKBP51801 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLCNKBP51801 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CLCNKBP51801 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLCNKBP51801 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLCNKBP51801 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLCNKBP51801 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLCNKBP51801 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLCNKBP51801 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLCNKBP51801 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLCNKBP51801 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLCNKBP51801 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CLCNKBP51801 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLCNKBP51801 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLCNKBP51801 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLCNKBP51801 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLCNKBP51801 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLCNKBP51801 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLCNKBP51801 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLCNKBP51801 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLCNKBP51801 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLCNKBP51801 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLCNKBP51801 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLCNKBP51801 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLCNKBP51801 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLCNKBP51801 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CLCNKBP51801 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLCNKBP51801 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLCNKBP51801 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLCNKBP51801 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLCNKBP51801 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLCNKBP51801 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLCNKBP51801 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLCNKBP51801 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLCNKBP51801 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLCNKBP51801 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLCNKBP51801 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLCNKBP51801 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLCNKBP51801 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLCNKBP51801 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLCNKBP51801 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLCNKBP51801 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLCNKBP51801 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLCNKBP51801 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLCNKBP51801 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLCNKBP51801 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLCNKBP51801 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLCNKBP51801 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLCNKBP51801 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCNKBP51801 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCNKBP51801 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCNKBP51801 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCNKBP51801 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLCNKBP51801 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CLCNKBP51801 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLCNKBP51801 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLCNKBP51801 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLCNKBP51801 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLCNKBP51801 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLCNKBP51801 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLCNKBP51801 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLCNKBP51801 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLCNKBP51801 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLCNKBP51801 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLCNKBP51801 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLCNKBP51801 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLCNKBP51801 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLCNKBP51801 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLCNKBP51801 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLCNKBP51801 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLCNKBP51801 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCNKBP51801 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCNKBP51801 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCNKBP51801 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLCNKBP51801 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCNKBP51801 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLCNKBP51801 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms