Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB9AP51151 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB9AP51151 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB9AP51151 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB9AP51151 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB9AP51151 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB9AP51151 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB9AP51151 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB9AP51151 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB9AP51151 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB9AP51151 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB9AP51151 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB9AP51151 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB9AP51151 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB9AP51151 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB9AP51151 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB9AP51151 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB9AP51151 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB9AP51151 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB9AP51151 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB9AP51151 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB9AP51151 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB9AP51151 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB9AP51151 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB9AP51151 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB9AP51151 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB9AP51151 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB9AP51151 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB9AP51151 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB9AP51151 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB9AP51151 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB9AP51151 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB9AP51151 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB9AP51151 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB9AP51151 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB9AP51151 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB9AP51151 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms