Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB9AP51151 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB9AP51151 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB9AP51151 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB9AP51151 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB9AP51151 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB9AP51151 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB9AP51151 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB9AP51151 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB9AP51151 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB9AP51151 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB9AP51151 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB9AP51151 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB9AP51151 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB9AP51151 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB9AP51151 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB9AP51151 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB9AP51151 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB9AP51151 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB9AP51151 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB9AP51151 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB9AP51151 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB9AP51151 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB9AP51151 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB9AP51151 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB9AP51151 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB9AP51151 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB9AP51151 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB9AP51151 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB9AP51151 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB9AP51151 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB9AP51151 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB9AP51151 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB9AP51151 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB9AP51151 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB9AP51151 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB9AP51151 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB9AP51151 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB9AP51151 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB9AP51151 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB9AP51151 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB9AP51151 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB9AP51151 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB9AP51151 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB9AP51151 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB9AP51151 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB9AP51151 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB9AP51151 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB9AP51151 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB9AP51151 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB9AP51151 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB9AP51151 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB9AP51151 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB9AP51151 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB9AP51151 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB9AP51151 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB9AP51151 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB9AP51151 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB9AP51151 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB9AP51151 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB9AP51151 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB9AP51151 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB9AP51151 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB9AP51151 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB9AP51151 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB9AP51151 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB9AP51151 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB9AP51151 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB9AP51151 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB9AP51151 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB9AP51151 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB9AP51151 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB9AP51151 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB9AP51151 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB9AP51151 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB9AP51151 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB9AP51151 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB9AP51151 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB9AP51151 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB9AP51151 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB9AP51151 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB9AP51151 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB9AP51151 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB9AP51151 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB9AP51151 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB9AP51151 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB9AP51151 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB9AP51151 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB9AP51151 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB9AP51151 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB9AP51151 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB9AP51151 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB9AP51151 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB9AP51151 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB9AP51151 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB9AP51151 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB9AP51151 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB9AP51151 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB9AP51151 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB9AP51151 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms