Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCT8P50990 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCT8P50990 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCT8P50990 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCT8P50990 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCT8P50990 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCT8P50990 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT8P50990 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT8P50990 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT8P50990 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCT8P50990 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCT8P50990 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCT8P50990 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCT8P50990 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCT8P50990 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCT8P50990 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCT8P50990 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT8P50990 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT8P50990 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT8P50990 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT8P50990 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT8P50990 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCT8P50990 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCT8P50990 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCT8P50990 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCT8P50990 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCT8P50990 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCT8P50990 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCT8P50990 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCT8P50990 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCT8P50990 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT8P50990 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT8P50990 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT8P50990 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT8P50990 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT8P50990 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT8P50990 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT8P50990 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCT8P50990 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCT8P50990 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT8P50990 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCT8P50990 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCT8P50990 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCT8P50990 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCT8P50990 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT8P50990 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT8P50990 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT8P50990 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT8P50990 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCT8P50990 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT8P50990 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT8P50990 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT8P50990 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT8P50990 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT8P50990 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT8P50990 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT8P50990 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT8P50990 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT8P50990 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT8P50990 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT8P50990 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT8P50990 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCT8P50990 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT8P50990 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT8P50990 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT8P50990 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT8P50990 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT8P50990 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT8P50990 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT8P50990 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT8P50990 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCT8P50990 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCT8P50990 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCT8P50990 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCT8P50990 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT8P50990 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT8P50990 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT8P50990 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCT8P50990 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCT8P50990 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCT8P50990 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCT8P50990 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCT8P50990 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCT8P50990 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCT8P50990 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCT8P50990 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCT8P50990 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCT8P50990 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCT8P50990 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCT8P50990 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCT8P50990 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCT8P50990 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCT8P50990 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCT8P50990 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCT8P50990 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCT8P50990 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCT8P50990 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCT8P50990 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCT8P50990 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCT8P50990 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms