Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
MTHFSP49914 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
MTHFSP49914 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MTHFSP49914 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
MTHFSP49914 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
MTHFSP49914 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
MTHFSP49914 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
MTHFSP49914 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MTHFSP49914 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
MTHFSP49914 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
MTHFSP49914 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MTHFSP49914 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MTHFSP49914 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MTHFSP49914 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
MTHFSP49914 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
MTHFSP49914 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
MTHFSP49914 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
MTHFSP49914 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
MTHFSP49914 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
MTHFSP49914 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
MTHFSP49914 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
MTHFSP49914 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MTHFSP49914 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
MTHFSP49914 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MTHFSP49914 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
MTHFSP49914 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
MTHFSP49914 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
MTHFSP49914 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
MTHFSP49914 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
MTHFSP49914 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
MTHFSP49914 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
MTHFSP49914 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MTHFSP49914 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MTHFSP49914 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
MTHFSP49914 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
MTHFSP49914 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
MTHFSP49914 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
MTHFSP49914 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MTHFSP49914 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
MTHFSP49914 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MTHFSP49914 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
MTHFSP49914 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
MTHFSP49914 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
MTHFSP49914 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MTHFSP49914 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
MTHFSP49914 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
MTHFSP49914 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
MTHFSP49914 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
MTHFSP49914 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
MTHFSP49914 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
MTHFSP49914 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
MTHFSP49914 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
MTHFSP49914 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
MTHFSP49914 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
MTHFSP49914 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
MTHFSP49914 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
MTHFSP49914 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
MTHFSP49914 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MTHFSP49914 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MTHFSP49914 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
MTHFSP49914 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MTHFSP49914 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MTHFSP49914 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MTHFSP49914 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
MTHFSP49914 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MTHFSP49914 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MTHFSP49914 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MTHFSP49914 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MTHFSP49914 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
MTHFSP49914 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
MTHFSP49914 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MTHFSP49914 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MTHFSP49914 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MTHFSP49914 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
MTHFSP49914 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
MTHFSP49914 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MTHFSP49914 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MTHFSP49914 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
MTHFSP49914 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MTHFSP49914 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
MTHFSP49914 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
MTHFSP49914 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
MTHFSP49914 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MTHFSP49914 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MTHFSP49914 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
MTHFSP49914 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
MTHFSP49914 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
MTHFSP49914 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
MTHFSP49914 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
MTHFSP49914 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
MTHFSP49914 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
MTHFSP49914 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
MTHFSP49914 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
MTHFSP49914 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MTHFSP49914 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
MTHFSP49914 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
MTHFSP49914 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MTHFSP49914 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
MTHFSP49914 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
MTHFSP49914 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms