Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC46.42■■■■■ 5.02
MTHFSP49914 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
MTHFSP49914 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
MTHFSP49914 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
MTHFSP49914 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
MTHFSP49914 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
MTHFSP49914 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.86■■■■■ 4.77
MTHFSP49914 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
MTHFSP49914 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
MTHFSP49914 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
MTHFSP49914 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
MTHFSP49914 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
MTHFSP49914 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
MTHFSP49914 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
MTHFSP49914 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
MTHFSP49914 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
MTHFSP49914 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
MTHFSP49914 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
MTHFSP49914 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
MTHFSP49914 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
MTHFSP49914 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
MTHFSP49914 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
MTHFSP49914 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
MTHFSP49914 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MTHFSP49914 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MTHFSP49914 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
MTHFSP49914 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
MTHFSP49914 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
MTHFSP49914 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
MTHFSP49914 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
MTHFSP49914 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
MTHFSP49914 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
MTHFSP49914 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
MTHFSP49914 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
MTHFSP49914 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
MTHFSP49914 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
MTHFSP49914 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
MTHFSP49914 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
MTHFSP49914 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
MTHFSP49914 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
MTHFSP49914 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
MTHFSP49914 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
MTHFSP49914 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.99■■■■■ 4.15
MTHFSP49914 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
MTHFSP49914 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
MTHFSP49914 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
MTHFSP49914 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
MTHFSP49914 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
MTHFSP49914 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
MTHFSP49914 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
MTHFSP49914 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
MTHFSP49914 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
MTHFSP49914 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
MTHFSP49914 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
MTHFSP49914 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
MTHFSP49914 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
MTHFSP49914 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
MTHFSP49914 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
MTHFSP49914 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
MTHFSP49914 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
MTHFSP49914 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
MTHFSP49914 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
MTHFSP49914 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
MTHFSP49914 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
MTHFSP49914 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
MTHFSP49914 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
MTHFSP49914 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
MTHFSP49914 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
MTHFSP49914 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
MTHFSP49914 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
MTHFSP49914 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
MTHFSP49914 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
MTHFSP49914 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
MTHFSP49914 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
MTHFSP49914 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
MTHFSP49914 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
MTHFSP49914 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
MTHFSP49914 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
MTHFSP49914 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
MTHFSP49914 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
MTHFSP49914 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
MTHFSP49914 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
MTHFSP49914 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
MTHFSP49914 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
MTHFSP49914 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
MTHFSP49914 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
MTHFSP49914 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
MTHFSP49914 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
MTHFSP49914 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
MTHFSP49914 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MTHFSP49914 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
MTHFSP49914 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
MTHFSP49914 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
MTHFSP49914 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
MTHFSP49914 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
MTHFSP49914 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
MTHFSP49914 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
MTHFSP49914 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
MTHFSP49914 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
MTHFSP49914 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms