Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HARS2P49590 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HARS2P49590 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HARS2P49590 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HARS2P49590 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HARS2P49590 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HARS2P49590 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HARS2P49590 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HARS2P49590 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HARS2P49590 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HARS2P49590 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HARS2P49590 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HARS2P49590 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HARS2P49590 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HARS2P49590 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HARS2P49590 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HARS2P49590 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HARS2P49590 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HARS2P49590 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HARS2P49590 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HARS2P49590 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HARS2P49590 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HARS2P49590 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HARS2P49590 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HARS2P49590 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HARS2P49590 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HARS2P49590 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HARS2P49590 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HARS2P49590 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HARS2P49590 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HARS2P49590 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HARS2P49590 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HARS2P49590 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HARS2P49590 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HARS2P49590 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HARS2P49590 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HARS2P49590 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HARS2P49590 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HARS2P49590 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HARS2P49590 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HARS2P49590 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HARS2P49590 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HARS2P49590 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HARS2P49590 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HARS2P49590 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HARS2P49590 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HARS2P49590 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HARS2P49590 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HARS2P49590 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HARS2P49590 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HARS2P49590 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HARS2P49590 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HARS2P49590 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HARS2P49590 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HARS2P49590 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HARS2P49590 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HARS2P49590 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HARS2P49590 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HARS2P49590 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HARS2P49590 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HARS2P49590 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HARS2P49590 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HARS2P49590 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HARS2P49590 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HARS2P49590 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HARS2P49590 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HARS2P49590 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HARS2P49590 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HARS2P49590 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HARS2P49590 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HARS2P49590 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HARS2P49590 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HARS2P49590 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HARS2P49590 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HARS2P49590 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HARS2P49590 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HARS2P49590 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HARS2P49590 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HARS2P49590 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HARS2P49590 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HARS2P49590 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HARS2P49590 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HARS2P49590 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HARS2P49590 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HARS2P49590 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HARS2P49590 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HARS2P49590 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HARS2P49590 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HARS2P49590 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HARS2P49590 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HARS2P49590 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HARS2P49590 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HARS2P49590 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HARS2P49590 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HARS2P49590 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HARS2P49590 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HARS2P49590 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HARS2P49590 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HARS2P49590 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HARS2P49590 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms