Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIA3P42263 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIA3P42263 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIA3P42263 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIA3P42263 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIA3P42263 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIA3P42263 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIA3P42263 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIA3P42263 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIA3P42263 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIA3P42263 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIA3P42263 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIA3P42263 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIA3P42263 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIA3P42263 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIA3P42263 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIA3P42263 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIA3P42263 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIA3P42263 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIA3P42263 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIA3P42263 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIA3P42263 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIA3P42263 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIA3P42263 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIA3P42263 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIA3P42263 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIA3P42263 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIA3P42263 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIA3P42263 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIA3P42263 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIA3P42263 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIA3P42263 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIA3P42263 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIA3P42263 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIA3P42263 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIA3P42263 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIA3P42263 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIA3P42263 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIA3P42263 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIA3P42263 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIA3P42263 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIA3P42263 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIA3P42263 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIA3P42263 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIA3P42263 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIA3P42263 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIA3P42263 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIA3P42263 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIA3P42263 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIA3P42263 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIA3P42263 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA3P42263 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIA3P42263 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIA3P42263 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIA3P42263 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIA3P42263 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIA3P42263 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIA3P42263 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIA3P42263 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIA3P42263 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIA3P42263 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIA3P42263 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIA3P42263 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIA3P42263 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIA3P42263 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIA3P42263 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIA3P42263 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIA3P42263 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIA3P42263 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIA3P42263 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIA3P42263 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIA3P42263 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIA3P42263 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIA3P42263 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIA3P42263 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIA3P42263 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIA3P42263 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIA3P42263 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIA3P42263 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIA3P42263 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIA3P42263 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIA3P42263 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIA3P42263 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIA3P42263 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIA3P42263 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIA3P42263 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIA3P42263 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIA3P42263 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIA3P42263 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIA3P42263 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIA3P42263 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIA3P42263 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIA3P42263 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIA3P42263 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms