Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD12P35452 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD12P35452 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD12P35452 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD12P35452 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD12P35452 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD12P35452 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXD12P35452 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXD12P35452 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXD12P35452 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXD12P35452 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXD12P35452 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXD12P35452 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXD12P35452 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXD12P35452 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD12P35452 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD12P35452 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXD12P35452 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD12P35452 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD12P35452 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD12P35452 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD12P35452 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD12P35452 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD12P35452 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD12P35452 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD12P35452 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD12P35452 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD12P35452 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD12P35452 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD12P35452 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD12P35452 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD12P35452 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD12P35452 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD12P35452 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD12P35452 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD12P35452 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD12P35452 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD12P35452 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD12P35452 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD12P35452 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD12P35452 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD12P35452 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD12P35452 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD12P35452 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD12P35452 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD12P35452 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD12P35452 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD12P35452 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD12P35452 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD12P35452 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD12P35452 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD12P35452 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD12P35452 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD12P35452 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXD12P35452 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXD12P35452 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXD12P35452 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXD12P35452 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD12P35452 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD12P35452 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXD12P35452 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXD12P35452 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HOXD12P35452 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXD12P35452 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXD12P35452 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HOXD12P35452 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXD12P35452 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXD12P35452 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXD12P35452 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXD12P35452 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXD12P35452 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXD12P35452 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXD12P35452 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXD12P35452 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXD12P35452 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXD12P35452 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXD12P35452 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD12P35452 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD12P35452 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD12P35452 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXD12P35452 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXD12P35452 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD12P35452 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD12P35452 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD12P35452 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms