Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HOXD12P35452 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HOXD12P35452 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HOXD12P35452 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HOXD12P35452 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HOXD12P35452 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
HOXD12P35452 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HOXD12P35452 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXD12P35452 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
HOXD12P35452 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HOXD12P35452 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HOXD12P35452 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HOXD12P35452 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HOXD12P35452 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HOXD12P35452 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
HOXD12P35452 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HOXD12P35452 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HOXD12P35452 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HOXD12P35452 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HOXD12P35452 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HOXD12P35452 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXD12P35452 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXD12P35452 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HOXD12P35452 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HOXD12P35452 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HOXD12P35452 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HOXD12P35452 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HOXD12P35452 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HOXD12P35452 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HOXD12P35452 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXD12P35452 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
HOXD12P35452 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HOXD12P35452 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
HOXD12P35452 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HOXD12P35452 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXD12P35452 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HOXD12P35452 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
HOXD12P35452 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HOXD12P35452 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXD12P35452 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HOXD12P35452 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXD12P35452 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HOXD12P35452 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXD12P35452 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXD12P35452 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXD12P35452 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXD12P35452 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXD12P35452 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXD12P35452 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXD12P35452 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXD12P35452 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXD12P35452 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXD12P35452 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXD12P35452 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXD12P35452 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXD12P35452 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXD12P35452 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HOXD12P35452 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
HOXD12P35452 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HOXD12P35452 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXD12P35452 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXD12P35452 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXD12P35452 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXD12P35452 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXD12P35452 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXD12P35452 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXD12P35452 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXD12P35452 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXD12P35452 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXD12P35452 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXD12P35452 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXD12P35452 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXD12P35452 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXD12P35452 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXD12P35452 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXD12P35452 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXD12P35452 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXD12P35452 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXD12P35452 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXD12P35452 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD12P35452 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD12P35452 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD12P35452 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXD12P35452 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXD12P35452 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXD12P35452 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXD12P35452 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXD12P35452 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXD12P35452 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXD12P35452 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXD12P35452 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXD12P35452 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXD12P35452 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXD12P35452 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXD12P35452 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXD12P35452 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXD12P35452 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXD12P35452 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXD12P35452 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXD12P35452 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms