Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHATP28329 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHATP28329 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHATP28329 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHATP28329 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHATP28329 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHATP28329 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHATP28329 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHATP28329 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHATP28329 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHATP28329 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHATP28329 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHATP28329 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHATP28329 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHATP28329 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHATP28329 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHATP28329 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHATP28329 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHATP28329 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHATP28329 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHATP28329 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHATP28329 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHATP28329 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHATP28329 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHATP28329 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHATP28329 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHATP28329 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHATP28329 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHATP28329 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHATP28329 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHATP28329 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHATP28329 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHATP28329 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHATP28329 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHATP28329 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHATP28329 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHATP28329 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHATP28329 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHATP28329 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHATP28329 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHATP28329 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHATP28329 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHATP28329 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHATP28329 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHATP28329 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHATP28329 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHATP28329 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHATP28329 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHATP28329 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHATP28329 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHATP28329 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHATP28329 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHATP28329 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHATP28329 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHATP28329 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHATP28329 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHATP28329 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHATP28329 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHATP28329 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHATP28329 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHATP28329 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHATP28329 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHATP28329 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHATP28329 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHATP28329 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHATP28329 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHATP28329 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHATP28329 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHATP28329 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHATP28329 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHATP28329 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHATP28329 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHATP28329 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHATP28329 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHATP28329 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHATP28329 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHATP28329 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHATP28329 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHATP28329 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHATP28329 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHATP28329 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHATP28329 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHATP28329 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHATP28329 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHATP28329 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHATP28329 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHATP28329 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHATP28329 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHATP28329 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHATP28329 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHATP28329 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHATP28329 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHATP28329 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHATP28329 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHATP28329 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHATP28329 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHATP28329 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHATP28329 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHATP28329 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHATP28329 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms