Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHATP28329 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHATP28329 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHATP28329 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHATP28329 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHATP28329 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHATP28329 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHATP28329 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHATP28329 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHATP28329 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHATP28329 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHATP28329 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHATP28329 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHATP28329 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHATP28329 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHATP28329 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHATP28329 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHATP28329 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHATP28329 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHATP28329 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHATP28329 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHATP28329 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHATP28329 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHATP28329 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHATP28329 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHATP28329 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHATP28329 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHATP28329 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHATP28329 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHATP28329 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHATP28329 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHATP28329 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHATP28329 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHATP28329 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHATP28329 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHATP28329 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHATP28329 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHATP28329 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHATP28329 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHATP28329 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHATP28329 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHATP28329 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHATP28329 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHATP28329 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHATP28329 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHATP28329 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHATP28329 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHATP28329 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHATP28329 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHATP28329 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHATP28329 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHATP28329 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHATP28329 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHATP28329 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHATP28329 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHATP28329 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHATP28329 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHATP28329 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHATP28329 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHATP28329 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHATP28329 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHATP28329 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHATP28329 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHATP28329 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHATP28329 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHATP28329 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHATP28329 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHATP28329 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHATP28329 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHATP28329 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHATP28329 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHATP28329 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHATP28329 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHATP28329 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHATP28329 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHATP28329 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHATP28329 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHATP28329 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHATP28329 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHATP28329 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHATP28329 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHATP28329 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHATP28329 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHATP28329 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHATP28329 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHATP28329 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHATP28329 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHATP28329 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHATP28329 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHATP28329 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHATP28329 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHATP28329 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHATP28329 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHATP28329 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHATP28329 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHATP28329 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHATP28329 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHATP28329 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHATP28329 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHATP28329 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms