Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMOD1P28289 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMOD1P28289 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TMOD1P28289 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TMOD1P28289 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TMOD1P28289 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TMOD1P28289 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TMOD1P28289 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TMOD1P28289 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TMOD1P28289 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TMOD1P28289 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TMOD1P28289 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TMOD1P28289 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TMOD1P28289 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TMOD1P28289 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMOD1P28289 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMOD1P28289 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMOD1P28289 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMOD1P28289 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMOD1P28289 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMOD1P28289 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TMOD1P28289 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TMOD1P28289 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TMOD1P28289 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMOD1P28289 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMOD1P28289 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMOD1P28289 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMOD1P28289 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMOD1P28289 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMOD1P28289 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMOD1P28289 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD1P28289 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD1P28289 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD1P28289 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD1P28289 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMOD1P28289 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMOD1P28289 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TMOD1P28289 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMOD1P28289 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMOD1P28289 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMOD1P28289 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMOD1P28289 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMOD1P28289 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMOD1P28289 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMOD1P28289 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMOD1P28289 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMOD1P28289 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMOD1P28289 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMOD1P28289 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMOD1P28289 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMOD1P28289 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMOD1P28289 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMOD1P28289 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TMOD1P28289 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMOD1P28289 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMOD1P28289 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMOD1P28289 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMOD1P28289 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMOD1P28289 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMOD1P28289 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMOD1P28289 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMOD1P28289 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMOD1P28289 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMOD1P28289 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMOD1P28289 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMOD1P28289 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMOD1P28289 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMOD1P28289 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMOD1P28289 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMOD1P28289 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMOD1P28289 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMOD1P28289 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TMOD1P28289 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMOD1P28289 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TMOD1P28289 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMOD1P28289 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMOD1P28289 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TMOD1P28289 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMOD1P28289 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMOD1P28289 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMOD1P28289 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMOD1P28289 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMOD1P28289 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMOD1P28289 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMOD1P28289 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
TMOD1P28289 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMOD1P28289 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TMOD1P28289 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms