Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HTR1BP28222 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HTR1BP28222 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HTR1BP28222 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTR1BP28222 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTR1BP28222 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTR1BP28222 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTR1BP28222 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTR1BP28222 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTR1BP28222 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HTR1BP28222 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HTR1BP28222 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HTR1BP28222 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HTR1BP28222 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HTR1BP28222 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HTR1BP28222 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HTR1BP28222 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HTR1BP28222 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTR1BP28222 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTR1BP28222 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTR1BP28222 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTR1BP28222 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTR1BP28222 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HTR1BP28222 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTR1BP28222 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTR1BP28222 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTR1BP28222 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HTR1BP28222 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTR1BP28222 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTR1BP28222 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTR1BP28222 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTR1BP28222 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTR1BP28222 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTR1BP28222 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTR1BP28222 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTR1BP28222 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTR1BP28222 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTR1BP28222 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTR1BP28222 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTR1BP28222 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTR1BP28222 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HTR1BP28222 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTR1BP28222 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HTR1BP28222 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTR1BP28222 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTR1BP28222 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTR1BP28222 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTR1BP28222 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTR1BP28222 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTR1BP28222 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTR1BP28222 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTR1BP28222 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTR1BP28222 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTR1BP28222 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTR1BP28222 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTR1BP28222 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTR1BP28222 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTR1BP28222 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTR1BP28222 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTR1BP28222 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTR1BP28222 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTR1BP28222 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTR1BP28222 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTR1BP28222 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTR1BP28222 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTR1BP28222 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTR1BP28222 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTR1BP28222 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTR1BP28222 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTR1BP28222 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTR1BP28222 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTR1BP28222 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HTR1BP28222 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTR1BP28222 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTR1BP28222 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTR1BP28222 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTR1BP28222 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTR1BP28222 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HTR1BP28222 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTR1BP28222 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTR1BP28222 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HTR1BP28222 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HTR1BP28222 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTR1BP28222 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HTR1BP28222 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTR1BP28222 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTR1BP28222 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTR1BP28222 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTR1BP28222 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTR1BP28222 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTR1BP28222 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTR1BP28222 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTR1BP28222 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTR1BP28222 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTR1BP28222 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTR1BP28222 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms