Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHMLP26374 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CHMLP26374 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHMLP26374 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CHMLP26374 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CHMLP26374 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CHMLP26374 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHMLP26374 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHMLP26374 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CHMLP26374 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHMLP26374 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHMLP26374 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHMLP26374 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHMLP26374 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHMLP26374 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHMLP26374 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHMLP26374 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHMLP26374 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHMLP26374 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHMLP26374 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHMLP26374 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHMLP26374 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHMLP26374 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHMLP26374 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHMLP26374 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHMLP26374 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHMLP26374 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHMLP26374 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHMLP26374 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHMLP26374 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHMLP26374 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHMLP26374 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHMLP26374 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CHMLP26374 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHMLP26374 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHMLP26374 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHMLP26374 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHMLP26374 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHMLP26374 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHMLP26374 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHMLP26374 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHMLP26374 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHMLP26374 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHMLP26374 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHMLP26374 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHMLP26374 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHMLP26374 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CHMLP26374 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHMLP26374 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHMLP26374 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHMLP26374 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHMLP26374 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CHMLP26374 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CHMLP26374 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHMLP26374 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHMLP26374 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHMLP26374 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHMLP26374 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHMLP26374 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHMLP26374 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHMLP26374 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHMLP26374 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHMLP26374 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHMLP26374 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHMLP26374 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHMLP26374 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHMLP26374 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHMLP26374 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHMLP26374 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHMLP26374 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHMLP26374 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHMLP26374 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHMLP26374 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHMLP26374 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHMLP26374 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHMLP26374 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHMLP26374 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHMLP26374 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHMLP26374 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHMLP26374 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHMLP26374 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHMLP26374 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHMLP26374 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHMLP26374 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHMLP26374 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHMLP26374 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHMLP26374 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHMLP26374 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHMLP26374 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHMLP26374 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHMLP26374 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHMLP26374 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHMLP26374 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHMLP26374 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHMLP26374 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CHMLP26374 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHMLP26374 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHMLP26374 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHMLP26374 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHMLP26374 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms