Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTSSP25774 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTSSP25774 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTSSP25774 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSSP25774 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSSP25774 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTSSP25774 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSSP25774 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTSSP25774 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTSSP25774 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSSP25774 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTSSP25774 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSSP25774 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSSP25774 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSSP25774 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSSP25774 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSSP25774 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSSP25774 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSSP25774 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSSP25774 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTSSP25774 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTSSP25774 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTSSP25774 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSSP25774 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSSP25774 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSSP25774 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSSP25774 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSSP25774 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSSP25774 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSSP25774 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSSP25774 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSSP25774 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSSP25774 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTSSP25774 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTSSP25774 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTSSP25774 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTSSP25774 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSSP25774 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTSSP25774 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTSSP25774 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTSSP25774 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTSSP25774 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTSSP25774 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTSSP25774 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSSP25774 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTSSP25774 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTSSP25774 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSSP25774 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSSP25774 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSSP25774 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSSP25774 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSSP25774 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSSP25774 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSSP25774 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSSP25774 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSSP25774 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSSP25774 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSSP25774 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSSP25774 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSSP25774 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSSP25774 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSSP25774 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSSP25774 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSSP25774 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSSP25774 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSSP25774 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSSP25774 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSSP25774 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSSP25774 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSSP25774 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSSP25774 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSSP25774 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSSP25774 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSSP25774 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSSP25774 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSSP25774 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSSP25774 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSSP25774 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSSP25774 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSSP25774 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSSP25774 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSSP25774 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSSP25774 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSSP25774 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSSP25774 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSSP25774 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSSP25774 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSSP25774 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSSP25774 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSSP25774 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSSP25774 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSSP25774 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSSP25774 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSSP25774 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSSP25774 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSSP25774 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSSP25774 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSSP25774 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSSP25774 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSSP25774 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms