Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBG1P23258 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBG1P23258 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBG1P23258 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBG1P23258 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBG1P23258 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBG1P23258 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBG1P23258 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBG1P23258 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBG1P23258 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBG1P23258 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBG1P23258 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBG1P23258 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBG1P23258 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBG1P23258 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBG1P23258 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBG1P23258 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBG1P23258 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBG1P23258 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBG1P23258 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBG1P23258 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBG1P23258 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBG1P23258 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBG1P23258 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBG1P23258 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBG1P23258 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBG1P23258 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBG1P23258 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBG1P23258 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBG1P23258 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBG1P23258 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBG1P23258 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBG1P23258 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBG1P23258 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBG1P23258 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBG1P23258 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBG1P23258 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBG1P23258 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBG1P23258 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBG1P23258 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBG1P23258 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBG1P23258 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBG1P23258 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBG1P23258 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBG1P23258 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBG1P23258 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBG1P23258 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBG1P23258 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBG1P23258 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBG1P23258 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBG1P23258 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBG1P23258 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBG1P23258 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBG1P23258 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBG1P23258 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBG1P23258 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBG1P23258 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBG1P23258 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBG1P23258 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBG1P23258 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBG1P23258 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms