Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TUBG1P23258 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBG1P23258 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBG1P23258 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBG1P23258 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBG1P23258 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBG1P23258 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBG1P23258 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBG1P23258 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBG1P23258 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBG1P23258 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBG1P23258 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBG1P23258 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBG1P23258 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBG1P23258 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBG1P23258 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBG1P23258 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBG1P23258 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBG1P23258 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBG1P23258 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBG1P23258 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBG1P23258 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBG1P23258 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBG1P23258 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBG1P23258 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBG1P23258 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBG1P23258 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBG1P23258 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBG1P23258 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBG1P23258 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBG1P23258 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBG1P23258 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBG1P23258 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBG1P23258 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBG1P23258 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBG1P23258 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBG1P23258 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBG1P23258 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBG1P23258 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBG1P23258 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBG1P23258 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBG1P23258 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBG1P23258 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBG1P23258 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBG1P23258 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBG1P23258 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBG1P23258 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBG1P23258 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBG1P23258 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBG1P23258 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBG1P23258 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBG1P23258 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBG1P23258 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBG1P23258 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBG1P23258 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBG1P23258 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBG1P23258 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBG1P23258 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBG1P23258 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBG1P23258 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBG1P23258 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBG1P23258 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBG1P23258 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBG1P23258 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBG1P23258 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBG1P23258 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBG1P23258 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBG1P23258 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBG1P23258 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBG1P23258 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBG1P23258 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBG1P23258 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBG1P23258 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBG1P23258 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBG1P23258 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBG1P23258 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBG1P23258 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBG1P23258 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBG1P23258 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBG1P23258 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBG1P23258 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBG1P23258 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBG1P23258 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBG1P23258 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBG1P23258 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBG1P23258 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBG1P23258 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBG1P23258 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBG1P23258 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBG1P23258 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBG1P23258 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBG1P23258 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBG1P23258 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBG1P23258 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBG1P23258 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBG1P23258 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBG1P23258 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBG1P23258 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBG1P23258 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBG1P23258 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms