Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRAP18433 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRAP18433 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRAP18433 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRAP18433 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRAP18433 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRAP18433 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRAP18433 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRAP18433 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRAP18433 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRAP18433 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRAP18433 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRAP18433 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRAP18433 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRAP18433 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRAP18433 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRAP18433 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRAP18433 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRAP18433 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRAP18433 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRAP18433 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRAP18433 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRAP18433 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRAP18433 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRAP18433 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRAP18433 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRAP18433 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRAP18433 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRAP18433 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRAP18433 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRAP18433 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRAP18433 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRAP18433 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRAP18433 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRAP18433 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRAP18433 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRAP18433 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRAP18433 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRAP18433 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTPRAP18433 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRAP18433 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRAP18433 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRAP18433 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRAP18433 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRAP18433 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRAP18433 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRAP18433 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRAP18433 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRAP18433 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRAP18433 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRAP18433 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRAP18433 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRAP18433 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRAP18433 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRAP18433 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRAP18433 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRAP18433 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRAP18433 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRAP18433 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRAP18433 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRAP18433 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRAP18433 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRAP18433 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRAP18433 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRAP18433 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRAP18433 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRAP18433 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRAP18433 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRAP18433 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRAP18433 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRAP18433 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRAP18433 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRAP18433 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRAP18433 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRAP18433 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRAP18433 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRAP18433 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRAP18433 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRAP18433 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRAP18433 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRAP18433 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRAP18433 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRAP18433 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRAP18433 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRAP18433 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRAP18433 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRAP18433 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRAP18433 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRAP18433 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRAP18433 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRAP18433 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRAP18433 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRAP18433 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRAP18433 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRAP18433 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRAP18433 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRAP18433 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRAP18433 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRAP18433 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRAP18433 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
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