Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNB2P17787 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHRNB2P17787 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CHRNB2P17787 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHRNB2P17787 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNB2P17787 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHRNB2P17787 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHRNB2P17787 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHRNB2P17787 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHRNB2P17787 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNB2P17787 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNB2P17787 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNB2P17787 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNB2P17787 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNB2P17787 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNB2P17787 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHRNB2P17787 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHRNB2P17787 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNB2P17787 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNB2P17787 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNB2P17787 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNB2P17787 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNB2P17787 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNB2P17787 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNB2P17787 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNB2P17787 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNB2P17787 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNB2P17787 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNB2P17787 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNB2P17787 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNB2P17787 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNB2P17787 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNB2P17787 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNB2P17787 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNB2P17787 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNB2P17787 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNB2P17787 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNB2P17787 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNB2P17787 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNB2P17787 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNB2P17787 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNB2P17787 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNB2P17787 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNB2P17787 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNB2P17787 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNB2P17787 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNB2P17787 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNB2P17787 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNB2P17787 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNB2P17787 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNB2P17787 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNB2P17787 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNB2P17787 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNB2P17787 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNB2P17787 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNB2P17787 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNB2P17787 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNB2P17787 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNB2P17787 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNB2P17787 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNB2P17787 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNB2P17787 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNB2P17787 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNB2P17787 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNB2P17787 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNB2P17787 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNB2P17787 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNB2P17787 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNB2P17787 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNB2P17787 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNB2P17787 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNB2P17787 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNB2P17787 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNB2P17787 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNB2P17787 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHRNB2P17787 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNB2P17787 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNB2P17787 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNB2P17787 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNB2P17787 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNB2P17787 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNB2P17787 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNB2P17787 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNB2P17787 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNB2P17787 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms