Protein–RNA interactions for Protein: P16442

ABO, Histo-blood group ABO system transferase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABOP16442 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABOP16442 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABOP16442 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABOP16442 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABOP16442 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABOP16442 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABOP16442 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABOP16442 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABOP16442 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABOP16442 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABOP16442 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABOP16442 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABOP16442 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABOP16442 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABOP16442 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABOP16442 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ABOP16442 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABOP16442 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABOP16442 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABOP16442 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABOP16442 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABOP16442 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABOP16442 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABOP16442 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABOP16442 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABOP16442 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABOP16442 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABOP16442 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABOP16442 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABOP16442 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABOP16442 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABOP16442 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABOP16442 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABOP16442 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABOP16442 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABOP16442 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABOP16442 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABOP16442 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABOP16442 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABOP16442 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABOP16442 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABOP16442 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABOP16442 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABOP16442 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABOP16442 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABOP16442 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABOP16442 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABOP16442 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABOP16442 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABOP16442 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABOP16442 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABOP16442 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ABOP16442 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABOP16442 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABOP16442 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ABOP16442 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABOP16442 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABOP16442 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABOP16442 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABOP16442 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABOP16442 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABOP16442 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABOP16442 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABOP16442 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABOP16442 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABOP16442 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABOP16442 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABOP16442 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABOP16442 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABOP16442 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABOP16442 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABOP16442 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABOP16442 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABOP16442 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABOP16442 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ABOP16442 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABOP16442 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABOP16442 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABOP16442 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABOP16442 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABOP16442 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABOP16442 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABOP16442 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABOP16442 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABOP16442 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABOP16442 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABOP16442 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABOP16442 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABOP16442 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABOP16442 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABOP16442 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABOP16442 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABOP16442 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABOP16442 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABOP16442 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABOP16442 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABOP16442 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABOP16442 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABOP16442 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABOP16442 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms