Protein–RNA interactions for Protein: P15086

CPB1, Carboxypeptidase B, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPB1P15086 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPB1P15086 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPB1P15086 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPB1P15086 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CPB1P15086 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPB1P15086 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPB1P15086 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPB1P15086 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPB1P15086 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPB1P15086 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPB1P15086 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CPB1P15086 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPB1P15086 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPB1P15086 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPB1P15086 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPB1P15086 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPB1P15086 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CPB1P15086 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CPB1P15086 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPB1P15086 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPB1P15086 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPB1P15086 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPB1P15086 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CPB1P15086 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPB1P15086 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPB1P15086 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPB1P15086 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPB1P15086 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPB1P15086 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPB1P15086 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CPB1P15086 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPB1P15086 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPB1P15086 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPB1P15086 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPB1P15086 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPB1P15086 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPB1P15086 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPB1P15086 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPB1P15086 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPB1P15086 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPB1P15086 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPB1P15086 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPB1P15086 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPB1P15086 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CPB1P15086 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CPB1P15086 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CPB1P15086 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPB1P15086 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPB1P15086 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPB1P15086 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPB1P15086 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPB1P15086 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPB1P15086 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPB1P15086 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPB1P15086 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPB1P15086 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPB1P15086 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPB1P15086 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CPB1P15086 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPB1P15086 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CPB1P15086 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPB1P15086 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CPB1P15086 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPB1P15086 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPB1P15086 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPB1P15086 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPB1P15086 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPB1P15086 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPB1P15086 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPB1P15086 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPB1P15086 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPB1P15086 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPB1P15086 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPB1P15086 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPB1P15086 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPB1P15086 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPB1P15086 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPB1P15086 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPB1P15086 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPB1P15086 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPB1P15086 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPB1P15086 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPB1P15086 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPB1P15086 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPB1P15086 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CPB1P15086 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPB1P15086 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPB1P15086 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPB1P15086 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPB1P15086 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPB1P15086 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CPB1P15086 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CPB1P15086 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPB1P15086 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CPB1P15086 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CPB1P15086 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CPB1P15086 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CPB1P15086 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPB1P15086 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPB1P15086 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms