Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH1P12830 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH1P12830 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH1P12830 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH1P12830 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH1P12830 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH1P12830 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDH1P12830 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH1P12830 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH1P12830 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH1P12830 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH1P12830 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDH1P12830 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDH1P12830 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH1P12830 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH1P12830 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH1P12830 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH1P12830 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH1P12830 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH1P12830 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH1P12830 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH1P12830 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH1P12830 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH1P12830 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH1P12830 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH1P12830 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH1P12830 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH1P12830 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH1P12830 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH1P12830 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH1P12830 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH1P12830 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH1P12830 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH1P12830 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH1P12830 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH1P12830 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH1P12830 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH1P12830 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH1P12830 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH1P12830 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH1P12830 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH1P12830 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH1P12830 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH1P12830 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH1P12830 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH1P12830 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH1P12830 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH1P12830 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH1P12830 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH1P12830 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH1P12830 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH1P12830 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH1P12830 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH1P12830 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH1P12830 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDH1P12830 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH1P12830 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH1P12830 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH1P12830 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH1P12830 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH1P12830 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH1P12830 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH1P12830 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH1P12830 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH1P12830 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH1P12830 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH1P12830 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH1P12830 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH1P12830 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH1P12830 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH1P12830 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH1P12830 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH1P12830 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH1P12830 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH1P12830 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH1P12830 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH1P12830 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH1P12830 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH1P12830 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH1P12830 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH1P12830 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH1P12830 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH1P12830 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH1P12830 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH1P12830 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH1P12830 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH1P12830 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH1P12830 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH1P12830 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH1P12830 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH1P12830 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH1P12830 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH1P12830 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH1P12830 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH1P12830 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDH1P12830 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH1P12830 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH1P12830 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH1P12830 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH1P12830 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms