Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CDH1P12830 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDH1P12830 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CDH1P12830 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDH1P12830 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDH1P12830 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CDH1P12830 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDH1P12830 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDH1P12830 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDH1P12830 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDH1P12830 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDH1P12830 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDH1P12830 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDH1P12830 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDH1P12830 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDH1P12830 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDH1P12830 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDH1P12830 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDH1P12830 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CDH1P12830 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDH1P12830 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDH1P12830 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDH1P12830 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDH1P12830 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDH1P12830 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDH1P12830 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDH1P12830 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDH1P12830 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDH1P12830 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CDH1P12830 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDH1P12830 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDH1P12830 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDH1P12830 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDH1P12830 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDH1P12830 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDH1P12830 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDH1P12830 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDH1P12830 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDH1P12830 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDH1P12830 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDH1P12830 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDH1P12830 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDH1P12830 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDH1P12830 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDH1P12830 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDH1P12830 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDH1P12830 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDH1P12830 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDH1P12830 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDH1P12830 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDH1P12830 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDH1P12830 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDH1P12830 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDH1P12830 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDH1P12830 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CDH1P12830 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDH1P12830 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDH1P12830 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDH1P12830 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDH1P12830 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDH1P12830 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CDH1P12830 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH1P12830 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH1P12830 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDH1P12830 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH1P12830 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDH1P12830 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDH1P12830 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDH1P12830 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDH1P12830 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDH1P12830 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDH1P12830 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDH1P12830 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDH1P12830 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDH1P12830 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDH1P12830 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDH1P12830 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH1P12830 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDH1P12830 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH1P12830 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH1P12830 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH1P12830 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH1P12830 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH1P12830 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDH1P12830 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDH1P12830 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH1P12830 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH1P12830 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH1P12830 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH1P12830 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH1P12830 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDH1P12830 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH1P12830 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH1P12830 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH1P12830 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH1P12830 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH1P12830 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDH1P12830 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDH1P12830 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CDH1P12830 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms