Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCNAP12004 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNAP12004 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCNAP12004 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCNAP12004 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCNAP12004 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCNAP12004 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNAP12004 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCNAP12004 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCNAP12004 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNAP12004 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNAP12004 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNAP12004 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNAP12004 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNAP12004 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNAP12004 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCNAP12004 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNAP12004 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNAP12004 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCNAP12004 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCNAP12004 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNAP12004 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCNAP12004 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCNAP12004 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCNAP12004 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCNAP12004 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCNAP12004 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCNAP12004 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCNAP12004 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCNAP12004 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCNAP12004 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCNAP12004 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCNAP12004 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCNAP12004 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCNAP12004 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCNAP12004 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCNAP12004 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCNAP12004 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCNAP12004 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCNAP12004 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCNAP12004 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCNAP12004 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCNAP12004 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCNAP12004 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCNAP12004 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCNAP12004 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCNAP12004 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNAP12004 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNAP12004 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNAP12004 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCNAP12004 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCNAP12004 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCNAP12004 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCNAP12004 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNAP12004 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNAP12004 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNAP12004 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNAP12004 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNAP12004 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNAP12004 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNAP12004 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCNAP12004 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCNAP12004 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCNAP12004 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCNAP12004 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCNAP12004 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCNAP12004 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCNAP12004 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCNAP12004 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCNAP12004 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCNAP12004 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCNAP12004 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCNAP12004 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCNAP12004 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCNAP12004 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PCNAP12004 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCNAP12004 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCNAP12004 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCNAP12004 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCNAP12004 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCNAP12004 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCNAP12004 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCNAP12004 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCNAP12004 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCNAP12004 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCNAP12004 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCNAP12004 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCNAP12004 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCNAP12004 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCNAP12004 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCNAP12004 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNAP12004 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCNAP12004 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNAP12004 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNAP12004 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCNAP12004 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PCNAP12004 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNAP12004 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCNAP12004 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCNAP12004 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms