Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP1P11387 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOP1P11387 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOP1P11387 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOP1P11387 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP1P11387 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP1P11387 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP1P11387 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP1P11387 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP1P11387 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP1P11387 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP1P11387 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP1P11387 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
TOP1P11387 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOP1P11387 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP1P11387 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOP1P11387 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP1P11387 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TOP1P11387 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOP1P11387 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOP1P11387 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOP1P11387 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOP1P11387 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP1P11387 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP1P11387 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP1P11387 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP1P11387 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP1P11387 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP1P11387 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP1P11387 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP1P11387 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP1P11387 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP1P11387 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP1P11387 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP1P11387 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP1P11387 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP1P11387 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP1P11387 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP1P11387 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP1P11387 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP1P11387 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TOP1P11387 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOP1P11387 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP1P11387 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOP1P11387 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOP1P11387 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOP1P11387 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOP1P11387 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOP1P11387 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP1P11387 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP1P11387 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP1P11387 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP1P11387 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP1P11387 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP1P11387 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOP1P11387 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOP1P11387 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP1P11387 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP1P11387 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP1P11387 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP1P11387 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP1P11387 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP1P11387 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP1P11387 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP1P11387 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP1P11387 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP1P11387 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP1P11387 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP1P11387 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP1P11387 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP1P11387 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP1P11387 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP1P11387 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP1P11387 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP1P11387 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP1P11387 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP1P11387 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP1P11387 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOP1P11387 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP1P11387 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP1P11387 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP1P11387 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP1P11387 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP1P11387 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP1P11387 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP1P11387 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP1P11387 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TOP1P11387 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOP1P11387 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP1P11387 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP1P11387 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOP1P11387 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOP1P11387 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOP1P11387 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP1P11387 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP1P11387 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP1P11387 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP1P11387 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP1P11387 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP1P11387 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms