Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PF4V1P10720 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PF4V1P10720 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PF4V1P10720 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PF4V1P10720 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PF4V1P10720 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PF4V1P10720 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PF4V1P10720 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PF4V1P10720 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PF4V1P10720 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PF4V1P10720 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PF4V1P10720 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PF4V1P10720 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PF4V1P10720 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PF4V1P10720 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PF4V1P10720 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PF4V1P10720 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PF4V1P10720 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PF4V1P10720 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PF4V1P10720 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PF4V1P10720 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PF4V1P10720 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PF4V1P10720 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PF4V1P10720 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PF4V1P10720 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PF4V1P10720 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PF4V1P10720 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PF4V1P10720 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PF4V1P10720 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PF4V1P10720 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PF4V1P10720 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PF4V1P10720 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PF4V1P10720 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PF4V1P10720 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PF4V1P10720 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PF4V1P10720 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PF4V1P10720 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PF4V1P10720 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PF4V1P10720 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PF4V1P10720 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PF4V1P10720 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PF4V1P10720 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PF4V1P10720 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms