Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSL3P1P0C860 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSL3P1P0C860 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSL3P1P0C860 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSL3P1P0C860 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSL3P1P0C860 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MSL3P1P0C860 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSL3P1P0C860 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSL3P1P0C860 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSL3P1P0C860 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSL3P1P0C860 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSL3P1P0C860 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSL3P1P0C860 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSL3P1P0C860 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSL3P1P0C860 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSL3P1P0C860 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSL3P1P0C860 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSL3P1P0C860 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSL3P1P0C860 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MSL3P1P0C860 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSL3P1P0C860 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSL3P1P0C860 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSL3P1P0C860 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSL3P1P0C860 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MSL3P1P0C860 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSL3P1P0C860 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSL3P1P0C860 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSL3P1P0C860 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSL3P1P0C860 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSL3P1P0C860 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSL3P1P0C860 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSL3P1P0C860 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSL3P1P0C860 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSL3P1P0C860 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSL3P1P0C860 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSL3P1P0C860 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSL3P1P0C860 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSL3P1P0C860 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MSL3P1P0C860 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSL3P1P0C860 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSL3P1P0C860 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSL3P1P0C860 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSL3P1P0C860 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSL3P1P0C860 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
MSL3P1P0C860 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MSL3P1P0C860 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSL3P1P0C860 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSL3P1P0C860 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSL3P1P0C860 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSL3P1P0C860 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSL3P1P0C860 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSL3P1P0C860 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSL3P1P0C860 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSL3P1P0C860 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSL3P1P0C860 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSL3P1P0C860 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSL3P1P0C860 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSL3P1P0C860 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MSL3P1P0C860 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSL3P1P0C860 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSL3P1P0C860 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSL3P1P0C860 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSL3P1P0C860 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSL3P1P0C860 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSL3P1P0C860 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSL3P1P0C860 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3P1P0C860 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3P1P0C860 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MSL3P1P0C860 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSL3P1P0C860 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSL3P1P0C860 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms