Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
VIL1P09327 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
VIL1P09327 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
VIL1P09327 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
VIL1P09327 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VIL1P09327 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VIL1P09327 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VIL1P09327 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VIL1P09327 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VIL1P09327 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VIL1P09327 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
VIL1P09327 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
VIL1P09327 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
VIL1P09327 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
VIL1P09327 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VIL1P09327 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
VIL1P09327 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
VIL1P09327 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
VIL1P09327 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
VIL1P09327 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
VIL1P09327 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
VIL1P09327 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
VIL1P09327 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VIL1P09327 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VIL1P09327 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VIL1P09327 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VIL1P09327 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
VIL1P09327 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
VIL1P09327 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
VIL1P09327 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
VIL1P09327 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VIL1P09327 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VIL1P09327 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
VIL1P09327 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VIL1P09327 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VIL1P09327 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
VIL1P09327 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
VIL1P09327 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
VIL1P09327 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
VIL1P09327 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
VIL1P09327 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
VIL1P09327 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.81■■■■□ 3
VIL1P09327 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
VIL1P09327 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
VIL1P09327 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
VIL1P09327 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
VIL1P09327 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
VIL1P09327 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
VIL1P09327 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
VIL1P09327 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
VIL1P09327 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
VIL1P09327 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VIL1P09327 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
VIL1P09327 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
VIL1P09327 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
VIL1P09327 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
VIL1P09327 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
VIL1P09327 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
VIL1P09327 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
VIL1P09327 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
VIL1P09327 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
VIL1P09327 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
VIL1P09327 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
VIL1P09327 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
VIL1P09327 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VIL1P09327 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
VIL1P09327 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
VIL1P09327 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
VIL1P09327 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
VIL1P09327 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
VIL1P09327 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VIL1P09327 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VIL1P09327 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
VIL1P09327 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VIL1P09327 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VIL1P09327 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
VIL1P09327 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
VIL1P09327 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VIL1P09327 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VIL1P09327 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VIL1P09327 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VIL1P09327 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
VIL1P09327 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
VIL1P09327 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
VIL1P09327 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
VIL1P09327 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
VIL1P09327 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
VIL1P09327 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
VIL1P09327 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VIL1P09327 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
VIL1P09327 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
VIL1P09327 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
VIL1P09327 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
VIL1P09327 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
VIL1P09327 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VIL1P09327 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VIL1P09327 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VIL1P09327 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VIL1P09327 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
VIL1P09327 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms