Protein–RNA interactions for Protein: P06315

IGKV5-2, Immunoglobulin kappa variable 5-2, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV5-2P06315 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
IGKV5-2P06315 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
IGKV5-2P06315 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
IGKV5-2P06315 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IGKV5-2P06315 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IGKV5-2P06315 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
IGKV5-2P06315 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
IGKV5-2P06315 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
IGKV5-2P06315 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
IGKV5-2P06315 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
IGKV5-2P06315 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IGKV5-2P06315 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
IGKV5-2P06315 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
IGKV5-2P06315 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
IGKV5-2P06315 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IGKV5-2P06315 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IGKV5-2P06315 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
IGKV5-2P06315 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
IGKV5-2P06315 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
IGKV5-2P06315 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
IGKV5-2P06315 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
IGKV5-2P06315 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
IGKV5-2P06315 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
IGKV5-2P06315 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
IGKV5-2P06315 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
IGKV5-2P06315 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
IGKV5-2P06315 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
IGKV5-2P06315 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
IGKV5-2P06315 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
IGKV5-2P06315 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
IGKV5-2P06315 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
IGKV5-2P06315 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
IGKV5-2P06315 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
IGKV5-2P06315 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
IGKV5-2P06315 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
IGKV5-2P06315 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
IGKV5-2P06315 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
IGKV5-2P06315 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
IGKV5-2P06315 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
IGKV5-2P06315 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
IGKV5-2P06315 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IGKV5-2P06315 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IGKV5-2P06315 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IGKV5-2P06315 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IGKV5-2P06315 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IGKV5-2P06315 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
IGKV5-2P06315 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
IGKV5-2P06315 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IGKV5-2P06315 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IGKV5-2P06315 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
IGKV5-2P06315 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
IGKV5-2P06315 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
IGKV5-2P06315 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
IGKV5-2P06315 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
IGKV5-2P06315 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
IGKV5-2P06315 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IGKV5-2P06315 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
IGKV5-2P06315 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
IGKV5-2P06315 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
IGKV5-2P06315 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
IGKV5-2P06315 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
IGKV5-2P06315 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
IGKV5-2P06315 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
IGKV5-2P06315 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
IGKV5-2P06315 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
IGKV5-2P06315 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
IGKV5-2P06315 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IGKV5-2P06315 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IGKV5-2P06315 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IGKV5-2P06315 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
IGKV5-2P06315 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
IGKV5-2P06315 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
IGKV5-2P06315 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
IGKV5-2P06315 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
IGKV5-2P06315 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
IGKV5-2P06315 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
IGKV5-2P06315 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
IGKV5-2P06315 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
IGKV5-2P06315 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
IGKV5-2P06315 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
IGKV5-2P06315 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
IGKV5-2P06315 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
IGKV5-2P06315 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
IGKV5-2P06315 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
IGKV5-2P06315 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
IGKV5-2P06315 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
IGKV5-2P06315 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
IGKV5-2P06315 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
IGKV5-2P06315 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
IGKV5-2P06315 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
IGKV5-2P06315 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
IGKV5-2P06315 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
IGKV5-2P06315 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
IGKV5-2P06315 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
IGKV5-2P06315 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
IGKV5-2P06315 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
IGKV5-2P06315 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
IGKV5-2P06315 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
IGKV5-2P06315 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IGKV5-2P06315 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms