Protein–RNA interactions for Protein: P06028

GYPB, Glycophorin-B, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPBP06028 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GYPBP06028 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GYPBP06028 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GYPBP06028 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GYPBP06028 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GYPBP06028 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GYPBP06028 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GYPBP06028 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GYPBP06028 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GYPBP06028 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GYPBP06028 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GYPBP06028 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GYPBP06028 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GYPBP06028 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GYPBP06028 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GYPBP06028 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GYPBP06028 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GYPBP06028 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GYPBP06028 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GYPBP06028 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GYPBP06028 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GYPBP06028 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GYPBP06028 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GYPBP06028 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GYPBP06028 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPBP06028 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPBP06028 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPBP06028 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPBP06028 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPBP06028 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPBP06028 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPBP06028 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPBP06028 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPBP06028 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GYPBP06028 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GYPBP06028 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GYPBP06028 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GYPBP06028 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GYPBP06028 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GYPBP06028 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GYPBP06028 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GYPBP06028 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GYPBP06028 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GYPBP06028 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GYPBP06028 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GYPBP06028 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GYPBP06028 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GYPBP06028 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GYPBP06028 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GYPBP06028 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GYPBP06028 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GYPBP06028 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GYPBP06028 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GYPBP06028 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GYPBP06028 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GYPBP06028 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GYPBP06028 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GYPBP06028 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GYPBP06028 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GYPBP06028 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYPBP06028 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYPBP06028 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYPBP06028 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYPBP06028 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GYPBP06028 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GYPBP06028 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GYPBP06028 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GYPBP06028 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GYPBP06028 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GYPBP06028 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GYPBP06028 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GYPBP06028 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GYPBP06028 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GYPBP06028 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GYPBP06028 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GYPBP06028 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GYPBP06028 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GYPBP06028 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GYPBP06028 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GYPBP06028 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GYPBP06028 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GYPBP06028 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GYPBP06028 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GYPBP06028 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GYPBP06028 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GYPBP06028 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GYPBP06028 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GYPBP06028 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GYPBP06028 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GYPBP06028 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GYPBP06028 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GYPBP06028 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GYPBP06028 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GYPBP06028 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYPBP06028 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYPBP06028 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GYPBP06028 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GYPBP06028 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GYPBP06028 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GYPBP06028 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms