Protein–RNA interactions for Protein: O95758

PTBP3, Polypyrimidine tract-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP3O95758 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTBP3O95758 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTBP3O95758 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTBP3O95758 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTBP3O95758 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTBP3O95758 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTBP3O95758 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTBP3O95758 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTBP3O95758 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTBP3O95758 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTBP3O95758 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTBP3O95758 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTBP3O95758 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTBP3O95758 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTBP3O95758 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTBP3O95758 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTBP3O95758 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTBP3O95758 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTBP3O95758 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTBP3O95758 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTBP3O95758 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTBP3O95758 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTBP3O95758 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTBP3O95758 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTBP3O95758 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTBP3O95758 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTBP3O95758 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTBP3O95758 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTBP3O95758 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTBP3O95758 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTBP3O95758 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTBP3O95758 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTBP3O95758 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTBP3O95758 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTBP3O95758 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTBP3O95758 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTBP3O95758 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTBP3O95758 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTBP3O95758 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTBP3O95758 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTBP3O95758 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTBP3O95758 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTBP3O95758 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.7 ms