Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDE8BO95263 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDE8BO95263 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDE8BO95263 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDE8BO95263 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDE8BO95263 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDE8BO95263 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDE8BO95263 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDE8BO95263 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PDE8BO95263 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDE8BO95263 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDE8BO95263 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PDE8BO95263 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDE8BO95263 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDE8BO95263 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDE8BO95263 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDE8BO95263 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDE8BO95263 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDE8BO95263 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDE8BO95263 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PDE8BO95263 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDE8BO95263 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDE8BO95263 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDE8BO95263 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDE8BO95263 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDE8BO95263 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDE8BO95263 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDE8BO95263 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDE8BO95263 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDE8BO95263 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDE8BO95263 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDE8BO95263 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDE8BO95263 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE8BO95263 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE8BO95263 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PDE8BO95263 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDE8BO95263 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PDE8BO95263 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDE8BO95263 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDE8BO95263 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDE8BO95263 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDE8BO95263 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDE8BO95263 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PDE8BO95263 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PDE8BO95263 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDE8BO95263 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDE8BO95263 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDE8BO95263 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDE8BO95263 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDE8BO95263 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDE8BO95263 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDE8BO95263 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDE8BO95263 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDE8BO95263 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDE8BO95263 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDE8BO95263 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDE8BO95263 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDE8BO95263 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDE8BO95263 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDE8BO95263 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDE8BO95263 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDE8BO95263 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDE8BO95263 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDE8BO95263 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDE8BO95263 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDE8BO95263 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDE8BO95263 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PDE8BO95263 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PDE8BO95263 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PDE8BO95263 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PDE8BO95263 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDE8BO95263 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PDE8BO95263 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PDE8BO95263 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PDE8BO95263 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDE8BO95263 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDE8BO95263 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDE8BO95263 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PDE8BO95263 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PDE8BO95263 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDE8BO95263 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDE8BO95263 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDE8BO95263 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms