Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDH8O95206 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDH8O95206 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDH8O95206 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDH8O95206 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDH8O95206 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDH8O95206 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDH8O95206 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDH8O95206 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDH8O95206 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDH8O95206 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDH8O95206 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDH8O95206 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDH8O95206 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDH8O95206 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDH8O95206 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDH8O95206 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDH8O95206 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDH8O95206 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDH8O95206 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDH8O95206 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDH8O95206 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDH8O95206 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDH8O95206 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDH8O95206 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDH8O95206 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDH8O95206 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDH8O95206 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDH8O95206 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDH8O95206 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDH8O95206 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDH8O95206 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDH8O95206 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDH8O95206 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDH8O95206 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDH8O95206 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDH8O95206 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDH8O95206 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDH8O95206 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDH8O95206 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDH8O95206 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDH8O95206 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDH8O95206 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDH8O95206 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDH8O95206 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDH8O95206 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDH8O95206 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDH8O95206 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDH8O95206 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDH8O95206 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDH8O95206 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDH8O95206 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDH8O95206 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDH8O95206 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDH8O95206 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDH8O95206 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDH8O95206 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDH8O95206 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDH8O95206 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDH8O95206 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDH8O95206 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDH8O95206 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDH8O95206 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDH8O95206 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDH8O95206 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDH8O95206 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDH8O95206 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDH8O95206 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDH8O95206 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDH8O95206 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDH8O95206 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDH8O95206 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDH8O95206 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH8O95206 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDH8O95206 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDH8O95206 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms