Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RTN3O95197 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTN3O95197 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTN3O95197 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTN3O95197 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN3O95197 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN3O95197 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTN3O95197 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RTN3O95197 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTN3O95197 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTN3O95197 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTN3O95197 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTN3O95197 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTN3O95197 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RTN3O95197 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTN3O95197 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTN3O95197 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTN3O95197 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTN3O95197 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTN3O95197 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTN3O95197 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTN3O95197 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RTN3O95197 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTN3O95197 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTN3O95197 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTN3O95197 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTN3O95197 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTN3O95197 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTN3O95197 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTN3O95197 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTN3O95197 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTN3O95197 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTN3O95197 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTN3O95197 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTN3O95197 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTN3O95197 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTN3O95197 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTN3O95197 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTN3O95197 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTN3O95197 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTN3O95197 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTN3O95197 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTN3O95197 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTN3O95197 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTN3O95197 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RTN3O95197 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTN3O95197 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RTN3O95197 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTN3O95197 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTN3O95197 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTN3O95197 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTN3O95197 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTN3O95197 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTN3O95197 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTN3O95197 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTN3O95197 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTN3O95197 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RTN3O95197 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTN3O95197 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTN3O95197 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN3O95197 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN3O95197 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN3O95197 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTN3O95197 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTN3O95197 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTN3O95197 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTN3O95197 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTN3O95197 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTN3O95197 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN3O95197 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN3O95197 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTN3O95197 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTN3O95197 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTN3O95197 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTN3O95197 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTN3O95197 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTN3O95197 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTN3O95197 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTN3O95197 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN3O95197 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN3O95197 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN3O95197 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTN3O95197 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTN3O95197 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTN3O95197 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN3O95197 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN3O95197 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN3O95197 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN3O95197 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN3O95197 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTN3O95197 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTN3O95197 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RTN3O95197 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTN3O95197 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTN3O95197 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTN3O95197 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTN3O95197 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTN3O95197 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTN3O95197 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTN3O95197 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms