Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYSFO75923 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYSFO75923 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYSFO75923 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYSFO75923 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYSFO75923 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYSFO75923 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYSFO75923 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYSFO75923 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DYSFO75923 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYSFO75923 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYSFO75923 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DYSFO75923 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYSFO75923 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYSFO75923 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYSFO75923 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYSFO75923 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYSFO75923 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYSFO75923 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYSFO75923 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYSFO75923 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYSFO75923 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYSFO75923 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYSFO75923 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYSFO75923 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DYSFO75923 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYSFO75923 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYSFO75923 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYSFO75923 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYSFO75923 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYSFO75923 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DYSFO75923 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYSFO75923 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYSFO75923 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYSFO75923 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYSFO75923 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYSFO75923 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYSFO75923 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYSFO75923 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DYSFO75923 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYSFO75923 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYSFO75923 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYSFO75923 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYSFO75923 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DYSFO75923 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYSFO75923 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYSFO75923 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYSFO75923 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYSFO75923 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYSFO75923 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYSFO75923 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYSFO75923 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYSFO75923 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYSFO75923 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYSFO75923 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYSFO75923 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYSFO75923 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DYSFO75923 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYSFO75923 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DYSFO75923 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYSFO75923 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYSFO75923 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYSFO75923 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYSFO75923 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYSFO75923 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYSFO75923 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYSFO75923 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYSFO75923 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYSFO75923 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYSFO75923 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYSFO75923 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYSFO75923 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYSFO75923 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYSFO75923 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYSFO75923 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYSFO75923 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DYSFO75923 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYSFO75923 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYSFO75923 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYSFO75923 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYSFO75923 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYSFO75923 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYSFO75923 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYSFO75923 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYSFO75923 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DYSFO75923 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYSFO75923 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYSFO75923 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYSFO75923 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYSFO75923 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYSFO75923 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYSFO75923 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DYSFO75923 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYSFO75923 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DYSFO75923 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYSFO75923 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYSFO75923 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYSFO75923 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DYSFO75923 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYSFO75923 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms