Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYSFO75923 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYSFO75923 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYSFO75923 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYSFO75923 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYSFO75923 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYSFO75923 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYSFO75923 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYSFO75923 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DYSFO75923 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYSFO75923 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYSFO75923 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DYSFO75923 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYSFO75923 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYSFO75923 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYSFO75923 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYSFO75923 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYSFO75923 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYSFO75923 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYSFO75923 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYSFO75923 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYSFO75923 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYSFO75923 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYSFO75923 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYSFO75923 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DYSFO75923 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYSFO75923 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYSFO75923 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYSFO75923 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYSFO75923 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYSFO75923 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DYSFO75923 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYSFO75923 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYSFO75923 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYSFO75923 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYSFO75923 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYSFO75923 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYSFO75923 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYSFO75923 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DYSFO75923 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYSFO75923 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYSFO75923 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYSFO75923 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYSFO75923 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DYSFO75923 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYSFO75923 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYSFO75923 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYSFO75923 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYSFO75923 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYSFO75923 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYSFO75923 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYSFO75923 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYSFO75923 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYSFO75923 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYSFO75923 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYSFO75923 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYSFO75923 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DYSFO75923 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYSFO75923 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DYSFO75923 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYSFO75923 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYSFO75923 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYSFO75923 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYSFO75923 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYSFO75923 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYSFO75923 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYSFO75923 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYSFO75923 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYSFO75923 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYSFO75923 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYSFO75923 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYSFO75923 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYSFO75923 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYSFO75923 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYSFO75923 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYSFO75923 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DYSFO75923 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYSFO75923 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYSFO75923 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYSFO75923 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYSFO75923 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYSFO75923 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYSFO75923 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYSFO75923 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYSFO75923 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DYSFO75923 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYSFO75923 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYSFO75923 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYSFO75923 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYSFO75923 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYSFO75923 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYSFO75923 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DYSFO75923 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYSFO75923 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DYSFO75923 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYSFO75923 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYSFO75923 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYSFO75923 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DYSFO75923 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DYSFO75923 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms